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首頁 全所PI名錄
  • 林一竹
  • 研究員，研究組長，博士生導(dǎo)師
  • E-mail: linyizhu@sibcb.ac.cn
  • 實(shí)驗(yàn)室主頁: https://linlab.sibcb.ac.cn
    個(gè)人簡介：

  • 2012年畢業(yè)于中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)，獲生命科學(xué)專業(yè)本科學(xué)位；2012年9月至2018年8月就讀于Carnegie Mellon University，獲Biological Sciences博士學(xué)位；2018年12月至2024年8月于University of California， San Francisco， Department of Cell and Tissue Biology從事博士后研究；于2024年9月起任中科院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)研究員，研究組長，博士生導(dǎo)師。

    社會(huì)任職：
    研究方向：
  • RNA及其結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu)與功能調(diào)控
    研究工作：

  • 本研究組圍繞RNA結(jié)合蛋白及其與RNA的相互作用進(jìn)行多項(xiàng)研究：

    （1）研發(fā)基于高通量測(cè)序的方法，實(shí)現(xiàn)RNA結(jié)構(gòu)與RNA結(jié)合蛋白作用相互關(guān)系的同時(shí)測(cè)量，揭示細(xì)胞內(nèi)RNA結(jié)構(gòu)動(dòng)態(tài)變化對(duì)RNA表達(dá)的調(diào)控作用。由于細(xì)胞內(nèi)RNA結(jié)構(gòu)的異質(zhì)性，其對(duì)RNA表達(dá)的調(diào)控機(jī)制仍是未知。本研究組通過RNA結(jié)構(gòu)與RNA結(jié)合蛋白的共同測(cè)量，解析RNA結(jié)構(gòu)的異質(zhì)性，及其在細(xì)胞狀態(tài)轉(zhuǎn)化過程中的動(dòng)態(tài)變化和動(dòng)態(tài)調(diào)控機(jī)制。

    （2）研發(fā)單分子RNA修飾標(biāo)記及高通量測(cè)序的方法解析RNA的異質(zhì)性以及其與多個(gè)RNA結(jié)合蛋白的相互作用，并實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞層面的RNA結(jié)合蛋白調(diào)控機(jī)制研究。這一研究成果將對(duì)細(xì)胞特異性的RNA結(jié)合蛋白調(diào)控機(jī)制及其對(duì)細(xì)胞命運(yùn)的調(diào)節(jié)帶來重大革新，并可應(yīng)用于RNA藥物設(shè)計(jì)中，實(shí)現(xiàn)細(xì)胞特異性的RNA表達(dá)調(diào)控，帶來重大社會(huì)經(jīng)濟(jì)意義。

    （3）揭示RNA病毒感染過程中宿主RNA結(jié)合蛋白對(duì)病毒RNA的免疫反應(yīng)、調(diào)控機(jī)制，及其相關(guān)致病機(jī)理。這一研究成果將對(duì)未來RNA病毒的致病機(jī)制理解有重大意義，并對(duì)抗病毒藥物的研發(fā)有重大指導(dǎo)意義。

    承擔(dān)科研項(xiàng)目情況：
    代表論著：

  • Peer-reviewed manuscripts

    1. Lin,Y., Kwok,S.,Thai,B.Q.,Alabi,Y.,Ostrowski,M.S.,Wu,K. and Floor,S.N. RNA molecular recording with an engineered RNA deaminase. Nature Methods. doi:10.1038/s41592-023-02046-z (2023)
    2. Jiang,Y.,Song,L.,Lin,Y. et al. ROS-mediated SRMS activation confers platinum resistance in ovarian cancer. Oncogene 42,1672–1684. https://doi.org/10.1038/s41388-023-02679-6 (2023)
    3. Gordon,D. E.,Jang,G. M.,…Lin,Y.,et al..A SARS-CoV-2 protein interaction map reveals targets for drug repurposing. Nature,583(7816),459–468. (2020)
    4. Lin,Y.*,May,G.E.*,Kready,H.,Nazzaro,L.,Mao,M.,Spealman,P.,Creeger,Y. and McManus,C.J. Impacts of uORF codon identity and position on translation regulation. Nucleic Acids Res.,2,1–10. (2019) (*equal contribution)
    5. Huang,B.,Zhang,K.,Lin,Y.,Sch?lkopf,B. and Glymour,C. Generalized score functions for causal discovery. Proc. ACM SIGKDD Int. Conf. Knowl. Discov. Data Min.,10.1145/3219819.3220104. (2018)
    6. Lin,Y.,Schmidt,B.F.,Bruchez,M.P. and McManus,C.J. Structural analyses of NEAT1 lncRNAs suggest long-range RNA interactions that may contribute to paraspeckle architecture. Nucleic Acids Res.,10.1093/nar/gky046. (2018)
    7. Lin,Y.,May,G.E. and McManus,C.J. Mod-seq: A high-throughput method for probing RNA secondary structure. Methods in enzymology 558,125-152 Elsevier Inc. (2015)
    8. Talkish,J.,May,G.,Lin,Y.,Woolford,J.L. and McManus,C.J. Mod-seq: high-throughput sequencing for chemical probing of RNA structure. RNA,20,713–20. (2014)

    Previews and Commentaries

    1. Lin,Y and Floor,S.N,RNA structure underpins a dynamic regulatory switch. Nature 621,259-260 (2023)
    獲獎(jiǎng)及榮譽(yù)：
    研究組成員：