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首頁(yè) 全所PI名錄
  • 韓碩
  • 研究員,研究組長(zhǎng),博士生導(dǎo)師
  • E-mail: shuohan@sibcb.ac.cn
  • 實(shí)驗(yàn)室主頁(yè): https://hanshuolab.sibcb.ac.cn
    個(gè)人簡(jiǎn)介:
  •   2014年畢業(yè)于清華大學(xué),獲化學(xué)生物學(xué)學(xué)士學(xué)位和計(jì)算機(jī)科學(xué)輔修學(xué)位;2014年9月至2020年1月先后就讀于美國(guó)麻省理工學(xué)院和斯坦福大學(xué),獲化學(xué)生物學(xué)博士學(xué)位;2020年2月至2022年12月,獲得Damon Runyon Foundation Fellowship,于美國(guó)斯坦福大學(xué)干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)研究所從事博士后研究;2023年1月起任中科院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)研究員,研究組長(zhǎng),博士生導(dǎo)師

    社會(huì)任職:
    研究方向:
  • 分子標(biāo)記技術(shù)的開(kāi)發(fā)與應(yīng)用
    研究工作:
  • 受自然啟發(fā)的生物大分子標(biāo)記技術(shù)

    自然界中多種生物化學(xué)反應(yīng)都涉及高度不穩(wěn)定且具有混雜反應(yīng)活性的瞬時(shí)中間體。這類反應(yīng)能夠以空間精準(zhǔn)且不受底物分子身份限制的方式,對(duì)周?chē)肿舆M(jìn)行模塊化標(biāo)記。通過(guò)挖掘大自然中的反應(yīng)體系,我們?nèi)诤匣瘜W(xué)合成、蛋白質(zhì)工程、人工智能分子設(shè)計(jì),在哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)重構(gòu)這些獨(dú)特的反應(yīng)活性。我們的研究聚焦兩大方向:發(fā)展用于科學(xué)發(fā)現(xiàn)的研究工具,開(kāi)發(fā)用于功能調(diào)控的治療技術(shù)。

    1.基于分子標(biāo)記的多維組學(xué)工具
    我們?cè)O(shè)計(jì)可基因編碼的標(biāo)記酶,用于高時(shí)空分辨的化學(xué)編碼和系統(tǒng)繪制活細(xì)胞中的信號(hào)網(wǎng)絡(luò)。通過(guò)將該分子標(biāo)記工具包與時(shí)空蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)等技術(shù)聯(lián)用,能夠助力發(fā)現(xiàn)活細(xì)胞內(nèi)的新型功能分子。我們還將數(shù)據(jù)集與大型語(yǔ)言模型整合,構(gòu)建具備預(yù)測(cè)功能的虛擬細(xì)胞。(代表性工作:Cell 2019,Cell 2020)

    2.基于分子標(biāo)記的功能調(diào)控技術(shù)
    我們利用生物活性底物的混雜性標(biāo)記特性,實(shí)現(xiàn)在體的生物大分子的功能性化學(xué)編輯,從而精確調(diào)控細(xì)胞間相互作用并重編程細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)。利用這些多樣化反應(yīng)的潛力,有望催生治療癌癥、自身免疫性疾病、組織再生和細(xì)胞衰老的新型療法。(代表性工作:Nature 2025)

    承擔(dān)科研項(xiàng)目情況:
    代表論著:
    1. Shuojun Li?, Yinghui Men?, Zihan Wang?, Yingcheng Wu?, Hao Sun, Mingyang Yin, Xinrui Fan, Guiyun Deng, Zhicheng Yang, Tiange Yang, Yudian Xiao, Hu Zhou, Guangchuan Wang, Jia Fan, Chenqi Xu, Qiang Gao*, and Shuo Han*. Amplifying antigen-induced cellular responses with proximity labelling. Nature 2025.
    2. Chuanyun Xu, Zhuoran Li, Cheng Lyu, Yixin Hu, Colleen N. McLaughlin, Kenneth Kin Lam Wong, Qijing Xie, David J. Luginbuhl, Hongjie Li, Namrata D. Udeshi, Tanya Svinkina, D. R. Mani, Shuo Han, Tongchao Li, Yang Li, Ricardo Guajardo, Alice Y. Ting, Steven A. Carr, Jiefu Li*, Liqun Luo*. Molecular and cellular mechanisms of teneurin signaling in synaptic partner matching.?Cell 2024, 187, 5081-5101.
    3. Shuo Han?, Boxuan S. Zhao?, Samuel A. Myers, Steven A. Carr, Chuan He, and Alice Y. Ting. RNA-protein interaction mapping via MS2- or Cas13-based APEX targeting.?PNAS 2020, 117, 22068-22079.
    4. Jiefu Li?, Shuo Han?, Hongjie Li, Namrata D. Udeshi, Tanya Svinkina, D. R. Mani, Chuanyun Xu, Ricardo Guajardo, Qijing Xie, Tongchao Li, David J. Luginbuhl, Bing Wu, Colleen N. McLaughlin, Anthony Xie, Pornchai Kaewsapsak, Stephen R. Quake, Steven A. Carr, Alice Y. Ting*, and Liqun Luo*. Cell-surface proteomic profiling in the fly brain uncovers wiring regulators.?Cell 2020, 180, 373-386.
    5. Yunxiao Zhang, Wan-Jin Lu, David P. Bulkley, Jiahao Liang, Arthur Ralko, Shuo Han, Kelsey J. Roberts, Anping Li, Wonhwa Cho, Yifan Cheng, Aashish Manglik, and Philip A. Beachy. Hedgehog pathway activation through nanobody-mediated conformational blockade of the Patched sterol conduit. PNAS 2020, 117, 28838-28846.
    6. Furqan Fazal?, Shuo Han?, Kevin R. Parker, Pornchai Kaewsapsak, Jin Xu, Alistair N. Boettiger, Howard Y. Chang*, and Alice Y. Ting*. Atlas of subcellular RNA localization revealed by APEX-seq.?Cell 2019, 178, 473-490.
    7. Shuo Han?, Jiefu Li?, and Alice Y. Ting. Proximity labeling: spatially resolved proteomic mapping for neurobiology.?Curr. Opin. Neurobiol. 2018, 50, 17-23.
    8. Shuo Han, Namrata D. Udeshi, Thomas J. Deerinck, Tanya Svinkina, Mark H. Ellisman, Steven A. Carr, and Alice Y. Ting. Proximity biotinylation as a method for mapping proteins associated with mtDNA in living cells.?Cell Chem. Biol. 2017, 24, 404-414.
    9. Omar O. Abudayyeh?, Jonathan S. Gootenberg?, Patrick Essletzbichler, Shuo Han, Julia Joung, Joseph J. Belanto, Vanessa Verdine, David B. T. Cox, Max J. Kellner, Aviv Regev, Eric S. Lander, Daniel F. Voytas, Alice Y. Ting, and Feng Zhang. RNA targeting with CRISPR-Cas13.?Nature 2017, 550, 280-284.
    獲獎(jiǎng)及榮譽(yù):
    研究組成員:
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