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[上海科技報(bào)]上??茖W(xué)家首次解碼核仁“加工廠”流水線

來源: 時(shí)間:2025-07-28

7月23日深夜,當(dāng)中國科學(xué)院分子細(xì)胞卓越創(chuàng)新中心陳玲玲研究員研究組的最新研究成果剛剛在線發(fā)表于《自然》一小時(shí)后,她就收到了一封來自美國哈佛大學(xué)學(xué)者的電子郵件。在郵件里,學(xué)者祝賀陳玲玲取得了“一個(gè)極為重要的基礎(chǔ)研究新突破”,并指出該成果對(duì)于造血干細(xì)胞等研究領(lǐng)域的重要啟示作用。

陳玲玲研究組的這項(xiàng)最新研究成果,首次繪制了核糖體RNA在核仁中的精密時(shí)空分布圖譜,并以此為基礎(chǔ)揭示了核仁內(nèi)部的組織架構(gòu)及其高效運(yùn)行的奧秘?!盎A(chǔ)研究是科技創(chuàng)新的源頭活水。正如CRISPR基因編輯工具的誕生源自科學(xué)家對(duì)原核生物的研究?!标惲崃嵴f,“隨著新技術(shù)應(yīng)用,我們對(duì)于核仁、核糖體RNA的認(rèn)識(shí)也在不斷加深,希望最終能轉(zhuǎn)化為治療相關(guān)疾病的新手段?!?/p>

從模糊到清晰,逐步看清核仁“加工廠”真容

核仁,位于細(xì)胞核里的“加工廠”。它通過精細(xì)劃分的多個(gè)功能“廠區(qū)”,協(xié)同調(diào)度著核糖體RNA的合成和加工流程,從而協(xié)調(diào)完成高效的核糖體合成與組裝任務(wù),服務(wù)于細(xì)胞生命活動(dòng)。一旦這個(gè)“加工廠”運(yùn)作失衡,身體就會(huì)出現(xiàn)問題:“加工速度”過快,會(huì)導(dǎo)致癌癥;“加工速度”過慢,會(huì)導(dǎo)致鳥面綜合征、貧血等核糖體疾病。

過去,由于技術(shù)限制,核仁“加工廠”的面貌一直模糊不清,人們對(duì)于核糖體RNA的空間“加工”流程也缺乏了解。此前研究認(rèn)為,核糖體RNA在核仁內(nèi)層的FC“廠區(qū)”和DFC“廠區(qū)”先完成配料準(zhǔn)備,然后統(tǒng)一輸送到外層的GC“廠區(qū)”進(jìn)行組裝。

如今,隨著多學(xué)科交叉技術(shù)的開發(fā)與應(yīng)用,核仁“加工廠”的真容開始顯現(xiàn)?!霸诔直媛曙@微鏡下,直徑只有600納米的核仁DFC層,與人類拍到的首張黑洞照片形態(tài)非常相似?!标惲崃犷H有感悟地說,“在我看來,無論是極宏觀尺度的黑洞,還是極微觀尺度的核仁,它們不僅有著高度相似的結(jié)構(gòu)圖像,還有著相似的科研探索歷程?!?/p>

在過去十多年里,陳玲玲研究組持續(xù)聚焦核仁結(jié)構(gòu)和核糖體RNA加工機(jī)制研究,采用創(chuàng)新交叉技術(shù),一步步接近并揭開核仁真相。除了借助分辨率大幅度提升的顯微成像技術(shù),研究組還不斷優(yōu)化RNA分子標(biāo)記技術(shù),給RNA貼上了越來越精準(zhǔn)的標(biāo)簽,從單分子尺度到單堿基尺度,使得研究人員能在空間和時(shí)間維度上“看得清”“看得準(zhǔn)”。

比想象更智能,核仁“加工廠”分工明確

在看清核仁“加工廠”的結(jié)構(gòu)全貌后,陳玲玲研究組進(jìn)一步解析了核糖體RNA的空間加工過程。研究組通過首次繪制核糖體RNA在核仁中的精密時(shí)空分布圖譜發(fā)現(xiàn),核仁“加工廠”有著精巧的“流水線”設(shè)計(jì):核糖體小亞基和大亞基的前體RNA在核仁中以兩條不同的“流水線”加工,分別安排在內(nèi)層的FC- PDFC“廠區(qū)”和外層的PDFC-GC“廠區(qū)”。

進(jìn)一步通過生理?xiàng)l件檢測(cè)和干預(yù)實(shí)驗(yàn)雙重驗(yàn)證,研究人員發(fā)現(xiàn),小亞基的前體RNA加工遲滯,會(huì)觸發(fā)核仁的質(zhì)量控制系統(tǒng),降低核糖體RNA的向外擴(kuò)散速率,進(jìn)而引發(fā)核仁結(jié)構(gòu)重組,導(dǎo)致內(nèi)層區(qū)域膨脹乃至破裂。

核仁內(nèi)層區(qū)域的結(jié)構(gòu)也決定了核糖體RNA的加工效率。在斑馬魚等低等生物中,內(nèi)層區(qū)域較為簡(jiǎn)單;而在人類等高等動(dòng)物中,核仁內(nèi)層區(qū)域演化出了FC-DFC雙層結(jié)構(gòu)。這種結(jié)構(gòu)升級(jí),有效提升了核糖體RNA的加工效率。核仁結(jié)構(gòu)的進(jìn)化,可能正是為了滿足復(fù)雜生長(zhǎng)需求而不斷“分工優(yōu)化”的結(jié)果。

這些新發(fā)現(xiàn)揭示了核仁結(jié)構(gòu)與功能之間的協(xié)同關(guān)系,核仁如同一個(gè)智能工廠合理分區(qū)才能保障運(yùn)作流暢,最終實(shí)現(xiàn)高效準(zhǔn)確的生產(chǎn)。通過解析核糖體RNA的成熟過程,陳玲玲團(tuán)隊(duì)提出了全新的時(shí)空分布模型,并揭示該模型在核仁多層結(jié)構(gòu)組織中的重要功能,為進(jìn)一步探究核糖體相關(guān)疾病的發(fā)生機(jī)制及開發(fā)潛在干預(yù)策略提供了基礎(chǔ)。

原載于上??萍紙?bào)2025-07-24

作者:耿挺

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