細(xì)胞核仁的主要功能之一是生成并加工核糖體RNA,進(jìn)而組裝蛋白質(zhì)合成的機(jī)器——核糖體。一旦核糖體RNA的“產(chǎn)生和加工過(guò)程”混亂,則會(huì)破壞核仁的結(jié)構(gòu)與功能,導(dǎo)致核糖體在“蛋白質(zhì)翻譯”時(shí)出現(xiàn)異常。目前已發(fā)現(xiàn),核仁與早期胚胎發(fā)育和腫瘤發(fā)生都存在緊密的聯(lián)系。
中科院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心陳玲玲研究組,2017年發(fā)現(xiàn)了一條全新的長(zhǎng)非編碼RNA,將其命名為SLERT,它可以結(jié)合核仁蛋白DDX21并改變其環(huán)狀結(jié)構(gòu)大小,進(jìn)而調(diào)控核糖體RNA的轉(zhuǎn)錄。但這背后的機(jī)制究竟是怎樣的,尚不清楚。
日前,陳玲玲與劉珈泉研究組第一次提出“RNA分子伴侶”機(jī)制,揭示了SLERT改變核仁蛋白DDX21的構(gòu)象,進(jìn)而影響核仁重要區(qū)域功能,確保核糖體RNA順利產(chǎn)生。該研究成果于2021年7月30日發(fā)表于國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》,并獲得同期專評(píng)。
“一個(gè)SLERT竟然可以調(diào)控幾百個(gè)核仁蛋白DDX21,這讓我們感到吃驚。”論文的共同第一作者之一、博士研究生吳曼告訴解放日?qǐng)?bào)·上觀新聞?dòng)浾摺iL(zhǎng)非編碼RNA通常以低劑量形式參與細(xì)胞命運(yùn)活動(dòng),而低劑量的SLERT卻可以調(diào)控高劑量的DDX21分子,這是如何實(shí)現(xiàn)的呢?
不妨把核仁蛋白DDX21想象成“一個(gè)人”,有時(shí)張開雙臂(開放構(gòu)象)與別人手拉手,有時(shí)雙手互握抱在胸前(閉合構(gòu)象)與別人肩并肩,SLERT更喜歡與雙臂張開的DDX21結(jié)合在一起,把它誘導(dǎo)成雙臂閉合之后,再去結(jié)合其他開放的DDX21分子,從而使得低劑量的SLERT作為“RNA分子伴侶”,可以不斷結(jié)合DDX21并協(xié)助其發(fā)生構(gòu)象改變。構(gòu)象改變的DDX21環(huán)狀結(jié)構(gòu)變得疏松,為核糖體RNA生成和加工提供了寬松的工作環(huán)境。
DDX21在較低濃度就能形成簇狀聚集,并且卷曲纏繞核糖體DNA,使得負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄的酶不能發(fā)揮作用,無(wú)法正常轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生核糖體RNA。正是由于SLERT促進(jìn)了DDX21的閉合構(gòu)象,增大了流動(dòng)性,可以阻止DDX21對(duì)核糖體DNA的包裹,讓轉(zhuǎn)錄酶順利結(jié)合核糖體RNA,維持核仁功能正常運(yùn)轉(zhuǎn),進(jìn)而順利組裝核糖體。
正如宇宙中存在著暗物質(zhì),在生命體這個(gè)“宇宙”中,非編碼RNA正是人類知之甚少的“暗物質(zhì)”。在人類基因轉(zhuǎn)錄組中,超過(guò)98%為非編碼RNA。越來(lái)越多的證據(jù)表明,一些重大疾病與非編碼RNA調(diào)控失衡相關(guān)。此次研究首次揭示了“RNA分子伴侶”跨越數(shù)量級(jí)調(diào)控核仁蛋白的機(jī)制,這對(duì)深入理解長(zhǎng)非編碼RNA分子功能具有重大意義。
原載于上觀新聞 2021年7月30日
作者:黃海華