3月9日,中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心陳玲玲研究組在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《自然》上發(fā)表的研究論文對(duì)核仁內(nèi)的蛋白質(zhì)進(jìn)行了定位篩選,通過超高分辨成像對(duì)200種蛋白質(zhì)在這個(gè)“超級(jí)工廠”內(nèi)的定位進(jìn)行了詳細(xì)研究。他們?cè)诤巳试镜娜龑咏Y(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上又發(fā)現(xiàn)了一層包裹在DFC外的新球殼狀區(qū)域,并將其命名為致密纖維成分外側(cè)區(qū)域(PDFC)。
核仁是細(xì)胞核里有著重要功能的無膜特殊結(jié)構(gòu),在顯微鏡下呈現(xiàn)直徑約為0.5-5微米的球狀結(jié)構(gòu)。核仁負(fù)責(zé)核糖體RNA的生成加工和核糖體的組裝。
過去的研究認(rèn)為核仁由三部分組成:纖維中心(FC)是核心,由致密纖維組分(DFC)包裹形成更大的球體,多個(gè)FC/DFC單元鑲嵌在同一顆粒組分(GC)里。通俗地講,核仁就像“超級(jí)工廠”一樣,每個(gè)FC/DFC單元就是一個(gè)“小車間”,每個(gè)“小車間”又通過流水線高效聯(lián)系,將新生的核糖體RNA運(yùn)入GC區(qū)域,也就是最后的統(tǒng)一“包裝站”,完成核糖體組裝,功能復(fù)雜而又重要。
然而核仁這個(gè)“超級(jí)工廠”是如何將自己復(fù)雜的結(jié)構(gòu)協(xié)同起來一起發(fā)揮作用,由內(nèi)向外加工新生核糖體RNA和組裝核糖體的呢?
進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)定位于PDFC“監(jiān)測(cè)站”的URB1蛋白質(zhì)是調(diào)控新生核糖體RNA 尾端折疊和加工的關(guān)鍵。URB1蛋白質(zhì)具有分子量大,流動(dòng)慢的特征。它仿佛一個(gè)體型龐大的“哨兵”,“看守”在PDFC區(qū)域,結(jié)合到由FC/DFC“小車間”運(yùn)輸而來的新生核糖體RNA尾端,與其他因子一起工作,去除末端。
該過程對(duì)于核糖體RNA的成熟和核糖體的組裝至關(guān)重要:末端剪切完成的核糖體RNA就會(huì)被URB1“哨兵”放行,進(jìn)入GC區(qū)域參與下一步核糖體組裝;一旦URB1“哨兵”消失,核糖體RNA就會(huì)帶著未剪切的尾端涌入GC區(qū)域,造成混亂,使得細(xì)胞無法正常運(yùn)作,同時(shí)也會(huì)引來外切酶體復(fù)合物的“鎮(zhèn)壓”。
在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,研究人員觀察到,缺失了URB1蛋白質(zhì)的斑馬魚會(huì)產(chǎn)生頭面部發(fā)育的畸形,無法成活。而URB1蛋白質(zhì)缺失的小鼠胚胎則無法著床,引發(fā)早期死亡。
此項(xiàng)研究工作多角度剖析了核仁這個(gè)“超級(jí)工廠”內(nèi)部的精細(xì)結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)了PDFC這一全新結(jié)構(gòu)。為研究核仁作為核糖體RNA“加工廠”的高效運(yùn)轉(zhuǎn)與質(zhì)控機(jī)制提供了全新的見解,也為核仁組裝和在胚胎發(fā)育中的潛在影響提供了新的研究思路。
原載于勞動(dòng)觀察 2023年3月9日
作者:王嘉露