人類的日常生存環(huán)境中存在著無窮無盡的病原體,而抗體是人體免疫系統(tǒng)對抗外界病原體入侵的主要分子“士兵”。這些人類的抗體分子由B淋巴細胞分泌的免疫球蛋白構成。當病原體入侵我們的免疫系統(tǒng)時,淋巴細胞通過基因突變等方法,利用甚至不足一百納米的DNA編碼多種多樣的抗體分子,“以萬變應萬變”,產生能夠針對性結合入侵病原體的抗體分子,這個過程被稱為抗體親和力成熟。
抗體分子在分子水平上長得像一個兩臂舉著武器的字母“Y”,最頂端的氨基酸是識別病原體的“武器”,而下方“身體”部分的氨基酸則負責維持抗體結構的穩(wěn)定和信息傳遞。不同的抗體分子擁有大致相同的“身體”,但它們頂部的“武器”卻千差萬別。
1981年,美國免疫學家大衛(wèi)?巴爾的摩等人發(fā)現,在抗體親和力成熟過程中,基因突變更傾向于發(fā)生在編碼識別病原體的“武器”區(qū)域。在一百納米的范圍內,基因突變?yōu)楹尉哂衅眯裕恢笔欠肿用庖邔W家苦苦追尋的問題。
4月24日深夜,國際學術期刊《細胞》在線發(fā)表了中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心(生物化學與細胞生物學研究所)孟飛龍研究組和上海交通大學醫(yī)學院上海市免疫學研究所葉菱秀研究組的合作研究論文。這一工作發(fā)現抗體基因DNA的力學性能,特別是柔性,決定了抗體親和力成熟過程中的基因突變效率。
在人體免疫系統(tǒng)中,B淋巴細胞是制造抗體士兵的工廠。它可以解讀抗體基因遺傳信息,并將其加工為一個個合格的士兵?!鞍彰摪泵窤ID”是B細胞工廠流水線上的魔鬼教練,他可以在抗體基因上制造基因突變,從而打造不同的抗體士兵。在抗體士兵的“武器”區(qū)域產生突變,可以產生擁有不同武器的士兵。但是如果在抗體士兵的“身體”部位產生突變,則可能產生不合格的士兵。
為什么在抗體基因上“武器”區(qū)域更容易發(fā)生突變,而“身體”區(qū)域的突變相對較少。上??茖W家的工作發(fā)現,原來抗體基因上“武器”區(qū)域更加柔軟,“身體”區(qū)域相對僵硬。在柔軟的地方,魔鬼教練更容易訓練該處的基因,從而產生更多的突變。
這是魔鬼教練(工具酶)和士兵材料(底物DNA)在漫長的進化過程中雙向奔赴的結果。相關機制在人類、猴子、小鼠、羊駝、兔子、狗甚至是鴨嘴獸中都普遍存在。
在人體細胞內部總長2米的DNA鏈條上,有的地方彎曲,有的地方筆直。該工作發(fā)現在抗體士兵制造過程中,DNA的柔性發(fā)揮了重要作用,也提示DNA柔性等力學性質可能在其它生命活動如腫瘤發(fā)生發(fā)展中,發(fā)揮重要作用。
分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心博士生王燕燕為該論文的第一作者,中心孟飛龍研究員和上海交通大學醫(yī)學院葉菱秀研究員為該論文的共同通訊作者。上海師范大學數學系博士生張森欣在數據分析,上海交通大學博士生楊欣瑞在分子動力學模擬,哈佛大學Joyce Hwang和王寵在模型構建等方面作出重要貢獻。該工作得到上海交通大學達林泰教授、上海交通大學醫(yī)學院鄭小琪教授、哈佛大學醫(yī)學院Frederick W. Alt教授、中國農業(yè)大學趙要風教授、瑞典卡羅林斯卡研究所Qiang Pan-Hammarstr?m教授、中國科學院杭州醫(yī)學所宋杰研究員、中國科學院生物物理研究所黃韶輝研究員、復旦大學曹志偉教授、分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心劉珈泉研究員等合作實驗室老師和同學的大力支持。該工作得到分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心動物實驗技術平臺、細胞分析技術平臺、分子生物學技術平臺的支持,同時得到來自基金委、科技部、中國科學院、上海市科委等部門的經費支持。
原載于東方網 2023年4月25日
作者:傅文婧